Nižšie sú uvedené najznámejšie a najčastejšie implementované protokoly aplikačnej vrstvy:
File Transfer Protocol (FTP) – zabezpečuje základný interaktívny prenos súborov medzi koncovými stanicami.
Telnet – umožňuje používateľom pristupovať ku vzdialeným staniciam prostredníctvom terminálu.
Simple Mail Transfer Protocol (SMTP) – podporuje základné služby prenosu správ.
Hypertext Transfer Protocol (HTTP) – podporuje prenos súborov obsahujúcich textovú aj grafickú informáciu. Využíva spojovaný a objektovo orientovaný protokol s jednoduchými príkazmi, ktoré umožňujú prenos objektov medzi klientom a serverom.
HyperText Transport Protocol Secure (HTTPS) – variant protokolu HTTP pre bezpečný prenos.
Domain Name Service (DNS) – transformuje IP adresy na názvy priradené zariadeniam na sieti a naopak.
Routing Information Protocol (RIP) – používajú sieťové zariadenia na výmenu smerovacích informácií.
Simple Network Management Protocol (SNMP) – je protokol používaný na zbieranie informácií týkajúcich sa správy siete.
Network File System (NFS) – je systém vyvinutý firmou Sun Microsystems, ktorý dovoľuje počítačom inštalovať diskové jednotky na vzdialených staniciach a pracovať s nimi ako keby boli lokálne.
Secure Sockets Layer (SSL) – je protokol na prenos súkromných dokumentov cez Internet.